Основной ущерб от массового отдыха людей на территории заказника может заключаться в следующем:
Такой фактор воздействия, как вытаптывание напочвенного покрова в лесах вдоль дорог и вблизи поселков, загрязнение этих территорий не может оказать прямого негативного воздействия на акваторию озер. Однако косвенное воздействие может быть достаточно велико. Непосредственное негативное воздействие на состояние акватории озера Охотничье и Большое Раковое может оказать сельскохозяйственная деятельность на территории водосборного бассейна озер.
В настоящее время рекреационная нагрузка на территорию озера Большое Раковое является умеренной. Это связано с наличием службы заказника, силами которой регулируется поток рыбаков на озеро и соблюдение ими режима охраны заказника.
В 2004 году, благодаря снижению фактора беспокойства, на территории заказника было обнаружено место гнездования лебедей.
На территории заказника расположено большое количество используемых сельскохозяйственных угодий и действующих животноводческих ферм. В связи с этим количественные показатели образования органических отходов и используемых удобрений, а также места их складирования, требуют дополнительного контроля.
Можно рекомендовать проведение ряда мероприятий и принятие определенных мер, которые впоследствии станут частью программы развития экотуризма на территории.
Для создания маршрутов экскурсий и информационных материалов для них возможно использование следующих тематик: